1、加盟店有时候闹独立性，难以控制。例如加盟店的业绩叫好，利润达到或超过预期时，加盟商可能产生一种认识，以为这功劳是自己的，并认为没有总部也能搞好，企图摆脱总部的指导和监督；而如果利润不好，他们也可能产生不满情绪，不想继续下去。这两种情绪如果不小心处理将会对总部产生较大不利影响。

　　2、公司声誉和形象会受到个别经营不好的加盟店影响。这既包括业绩惨淡带来的负面影响，也包括加盟店不按照总部标准执行，在产品标价和折扣方面自作主张，服务不到位，甚至可能以次充好，保证不了产品质量，只顾眼前利益，不考虑品牌长远发展等等带来的对总部的声誉和事业的发展造成的影响。

　　连锁加盟对加盟商的不利之处主要有下面几点：

　　1、经营受到严格约束，缺乏自主性。每个地区的实际情况不一样，视分店周围环境的不同，人们生活水平、竞争程度、消费习惯等不同需要采取不同的营销策略，以适应当地实际需求，达到利润最大化。然而总部不愿为了个别分店改动全线价格，加盟店没办法只能放弃满脑子别出心裁的主意，循规蹈矩了。

　　2、加盟总部出现决策失误时，加盟店会受到牵连。如果加盟总部在制定有关企业革新的决定上出现失误，就会使整个加盟体系受到损失，甚至全盘失败。

　　3、过分标准化的产品和服务不一定适合当地市场。总部在追赶潮流的进程中需要一段时间有条不紊地进行，不像小个体商店那样迅速，而且总部的改动也往往从全局出发，忽略个别地区的具体情况。

　　4、发展速度过快时，总部的后续服务跟不上。这种情况很多，目前有许多新崛起的品牌，就是因为膨胀过快，物流和服务无法跟上发展节奏，出现不和谐音符，各个加盟分部深受影响。

　　5、加盟店的退出或转让会受到合同限制，困难重重。